Bacterial and plankton communities in mariculture water sources: a case study in Nampu and Sembukan seawaters, Wonogiri, Indonesia
Autori: Yuni Puji Hastuti, Yuli Siti Fatma, Hardi Pitoyo, Yusli Wardiatno, Siska Tidesianti
Autori i afilijacije
Morske vode Indonezije dio su tropskog morskog ekosustava i karakterizira ih velika raznolikost mikroorganizama i planktona. Morska voda koristi se za potrebe marikulture, npr. pri uzgoju kozica, mliječne ribe, hlapova te mangrovskog raka. Održivost okolišnih izvora koji se koriste u marikulturi može biti procijenjena analiziranjem stvarnih uvjeta u morskom okolišu, uključujući bakterijske i planktonske zajednice. No karakteristike tih zajednica u indonezijskim vodama nisu dobro dokumentirane. U ovom radu istražujemo bakterijske i planktonske zajednice u površinskim vodama dvaju obalnih područja, Nampu i Sembukan, uprava Wonogiri, središnja Java, Indonezija. Raznolikost bakterija analizirana je pomoću brzog Illumina sekvencioniranja s primerom za regiju V3-V4 bakterijske sekvence gena 16S rRNA. Osim toga, određena je i izračunata planktonska zajednica (fitoplankton i zooplankton) koristeći metodu komorice za brojanje. Sekvencirajuća analiza pokazala je da je pet dominantnih bakterijskih koljena u dva uzorka morske vode bilo zajedničko, a to su Proteobacteria, Firmicutes, Actinobacteria, Bacteriodetes i Cyanobacteria. Iako su dva uzorkovana područja udaljena nekoliko kilometara, rasprostranjenost dominirajućih bakterijskih koljena u oba uzorka bila je slična. U fitoplanktonu područja Nampu i Sembukan dominirali su Trichodesmium sp., Navicula sp. i Rhabdonema sp. Dominantni zooplankton u oba područja sastojao se od rodova Euterpina, Nauplius, Oithona sp., Oncaea sp., Tigriopus sp. i ličinki Gastropoda. Morska voda područja Nampu i Sembukan prikladna je kao izvor vode za akvakulturu.
Sažetak
Morske vode Indonezije dio su tropskog morskog ekosustava i karakterizira ih velika raznolikost mikroorganizama i planktona. Morska voda koristi se za potrebe marikulture, npr. pri uzgoju kozica, mliječne ribe, hlapova te mangrovskog raka. Održivost okolišnih izvora koji se koriste u marikulturi može biti procijenjena analiziranjem stvarnih uvjeta u morskom okolišu, uključujući bakterijske i planktonske zajednice. No karakteristike tih zajednica u indonezijskim vodama nisu dobro dokumentirane. U ovom radu istražujemo bakterijske i planktonske zajednice u površinskim vodama dvaju obalnih područja, Nampu i Sembukan, uprava Wonogiri, središnja Java, Indonezija. Raznolikost bakterija analizirana je pomoću brzog Illumina sekvencioniranja s primerom za regiju V3-V4 bakterijske sekvence gena 16S rRNA. Osim toga, određena je i izračunata planktonska zajednica (fitoplankton i zooplankton) koristeći metodu komorice za brojanje. Sekvencirajuća analiza pokazala je da je pet dominantnih bakterijskih koljena u dva uzorka morske vode bilo zajedničko, a to su Proteobacteria, Firmicutes, Actinobacteria, Bacteriodetes i Cyanobacteria. Iako su dva uzorkovana područja udaljena nekoliko kilometara, rasprostranjenost dominirajućih bakterijskih koljena u oba uzorka bila je slična. U fitoplanktonu područja Nampu i Sembukan dominirali su Trichodesmium sp., Navicula sp. i Rhabdonema sp. Dominantni zooplankton u oba područja sastojao se od rodova Euterpina, Nauplius, Oithona sp., Oncaea sp., Tigriopus sp. i ličinki Gastropoda. Morska voda područja Nampu i Sembukan prikladna je kao izvor vode za akvakulturu.
Ključne riječi
raznolikost bakterija, mikrobiom, plankton, morska voda, tropska mora